这是目前国内产品管控比较薄弱的一个地方，也是目前玻璃钢屋顶风机质量问题而被投诉的另一个要点。玻璃钢屋顶风机应有良好的声学指标，为控制噪音，风机转速不宜高于1500rpm，但实际的情况是玻璃钢屋顶风机的运行转速大大超出，噪音很大，造成这一问题的原因多在于玻璃钢屋顶风机中选型匹配的不合理，片面的最求低成本化，风机往高速化、小型化发展。另一个原因是厂家质量管理不严，装配工责任心不强，造成产品质量不稳定。
另外，针对不同的场合应选用适合的风机，如离心屋顶风机主要采用后向离心叶轮，因叶轮的特性限制主要为排风机，该风机的主要特点是余压较高，主要应用于局部排风系统，因该类玻璃钢屋顶风机无蜗壳，叶轮高速旋转所产生的空气动压不能有效的转变为静压，因而空气动力性能很不理想，耗电量较高，仅用于排风阻力较大的系统，一般全室通风系统应尽可能避免采用此种屋顶风机，而轴流式屋顶风机刚好与之相反。